产品货号:
YTB3025
中文名称:
pUC18 SARS-CoV-2 ORF1ab质粒
英文名称:
pUC18-SARS-CoV-2-ORF1ab
产品规格:
1μg|100μg
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1~3天
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pUC18 SARS-CoV-2 ORF1ab质粒所克隆的ORF1ab(168bp)含有中国疾控中心所公布的SARS-CoV-2冠状病毒基因组中开放读码框ORF1ab(open reading frame 1ab,ORF1ab)荧光检测RT-PCR特异性引物(1ab-F:5'-CCCTGTGGGTTTTACACTTAA-3';1ab-R:5'-ACGATTGTGCATCAGCTGA-3',该对引物扩增产生119bp片段)扩增所包含区域,该克隆适用于SARS-CoV-2的特异性检测。
SARS-CoV-2 ORF1大约占整个基因组长度的三分之二,位于病毒基因组5'端,编码病毒复制酶,包括ORF1a和ORF1b。ORF1a和ORF1b分别编码两个多聚蛋白(poly-protein)即pp1a和pp1ab,多聚蛋白产生后,被病毒编码的类胰凝乳蛋白酶(chymotrypsin-like protease,3CLpro)或1-2个类木瓜蛋白酶(papain-like protease,PLP)水解为具有独立生物学功能的十六个非结构蛋白(NSP1-NSP16),其中ORF1a编码NSP1-NSP11,而ORF1b编码NSP12-16。
pUC18 SARS-CoV-2 ORF1ab质粒的主要信息如下:
pUC18 SARS-CoV-2 ORF1ab质粒(2830bp)的图谱如下:
pUC18 SARS-CoV-2 ORF1ab质粒的多克隆位点的详细图谱如下:
pUC18 SARS-CoV-2 ORF1ab质粒中没有的酶切位点包括:
pUC18 SARS-CoV-2 ORF1ab质粒中的单酶切位点包括:
pUC18 SARS-CoV-2 ORF1ab质粒中推荐使用的测序引物序列如下:
M13 fwd(378-395):5'- TGTAAAACGACGG CCAGT -3'
M13 rev (608-625):5'- CAGGAAACAGCTATGACC -3'
使用说明:
相关搜索:pUC18 SARS-CoV-2 ORF1ab质粒,新冠病毒ORF1ab质粒,新型冠状病毒ORF1ab质粒,pUC18-SARS-CoV-2-ORF1ab
SARS-CoV-2 ORF1大约占整个基因组长度的三分之二,位于病毒基因组5'端,编码病毒复制酶,包括ORF1a和ORF1b。ORF1a和ORF1b分别编码两个多聚蛋白(poly-protein)即pp1a和pp1ab,多聚蛋白产生后,被病毒编码的类胰凝乳蛋白酶(chymotrypsin-like protease,3CLpro)或1-2个类木瓜蛋白酶(papain-like protease,PLP)水解为具有独立生物学功能的十六个非结构蛋白(NSP1-NSP16),其中ORF1a编码NSP1-NSP11,而ORF1b编码NSP12-16。
pUC18 SARS-CoV-2 ORF1ab质粒的主要信息如下:
Feature Nucleotide | Position |
M13/pUC Forward Primer | 378-395 |
ORF1ab | 405-572 |
Multiple cloning site | 573-594 |
M13/pUC Reverse Primer | 608-625 |
Lac operator | 633-649 |
Lac Promoter | 657-687 |
ColE1 origin of replication(Ori) | 1011-1599 |
Synthetic Beta-lactamase (Ampr) coding region | 1770-2630 |
pUC18 SARS-CoV-2 ORF1ab质粒(2830bp)的图谱如下:
pUC18 SARS-CoV-2 ORF1ab质粒的多克隆位点的详细图谱如下:
pUC18 SARS-CoV-2 ORF1ab质粒中没有的酶切位点包括:
AccI | AfeI | AflII | AgeI | AleI | ApaI | AscI |
AsiSI | AvrII | BaeI | BbsI | BbvCI | BfuAI | BglII |
BlpI | BmgBI | BmtI | Bpu10I | BsaAI | BsaBI | BseRI |
BsgI | BsiWI | BsmFI | BsmI | BspDI | BspEI | BspMI |
BsrGI | BssHII | BstBI | BstEII | BstXI | BstZ17I | Bsu36I |
BtgI | BtgZI | ClaI | CspCI | DraIII | EagI | EcoNI |
EcoRV | FseI | HincII | HpaI | MfeI | MluI | MscI |
NaeI | NcoI | NgoMIV | NheI | NotI | NruI | NsiI |
PacI | PaeR7I | PflFI | PflMI | PmeI | PmlI | PpuMI |
PshAI | PsiI | PspOMI | PspXI | PstI | RsrII | SacII |
SalI | SbfI | SexAI | SfiI | SgrAI | SnaBI | SpeI |
SphI | SrfI | StuI | StyI | SwaI | Tth111I | XbaI |
XcmI | XhoI |
pUC18 SARS-CoV-2 ORF1ab质粒中的单酶切位点包括:
AatII | G,ACGT`C | 966 | EcoO109I | RG`GNC,CY | 2571 |
Acc65I | G`GTAC,C | 660 | EcoRI | G`AATT,C | 1324 |
AflIII | A`CRYG,T | 664 | HindIII | A`AGCT,T | 1460 |
AhdI | GACNN,NN`NGTC | 999 | KasI | G`GCGC,C | 2654 |
AlwNI | CAG,NNN`CTG | 4176 | KpnI | G,GTAC`C | 2572 |
ApoI | R`AATT,Y | 977 | NarI | GG`CG,CC | 240 |
AvaI | C`YCGR,G | 935 | NdeI | CA`TA,TG | 597 |
BamHI | G`GATC,C | 1231 | NmeAIII | GCCGAG(N)19,NN` | 977 |
BanII | G,RGCYC | 971 | PciI | A`CATG,T | 4490 |
BcgI | ,NN`(N)10CGA(N)6TGC(N)10,NN` | 601 | PluTI | G,GCGC`C | 2690 |
BclI | T`GATC,A | 3561 | SacI | G,AGCT`C | 2575 |
BpmI | CTGGAG(N)14,NN` | 1624 | SapI | GCTCTTCN`NNN, | 995 |
BsaI | GGTCTCN`NNNN, | 2390 | ScaI | AGT|ACT | 951 |
BsaXI | ,NNN`(N)9AC(N)5CTCC(N)7,NNN` | 977 | SfoI | GGC|GCC | 1077 |
BseYI | C`CCAG,C | 2412 | SmaI | CCC|GGG | 3088 |
BsoBI | C`YCGR,G | 2805 | SspI | AAT|ATT | 655 |
BspQI | GCTCTTCN`NNN, | 3254 | TspMI | C`CCGG,G | 965 |
BsrFI | R`CCGG,Y | 1413 | XmaI | C`CCGG,G | 2347 |
BstAPI | GCAN,NNN`NTGC | 2412 | XmnI | GAANN|NNTTC | 2573 |
Eco53kI | GAG|CTC | 382 | ZraI | GAC|GTC | 346 |
pUC18 SARS-CoV-2 ORF1ab质粒中推荐使用的测序引物序列如下:
M13 fwd(378-395):5'- TGTAAAACGACGG CCAGT -3'
M13 rev (608-625):5'- CAGGAAACAGCTATGACC -3'
使用说明:
- 首次使用1μg包装的本产品时,请先取少量本质粒转化大肠杆菌,进行质粒小量、中量或大量抽提后再用于后续用途。抽提获得的质粒可以通过酶切电泳进行鉴定,或通过测序进行鉴定。
- 100μg包装的本产品质粒浓度为0.1μg/μl,共1ml。可以直接用于酶切。
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