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pUC18 SARS-CoV-2 ORF1ab质粒图片
产品货号:
YTB3025
中文名称:
pUC18 SARS-CoV-2 ORF1ab质粒
英文名称:
pUC18-SARS-CoV-2-ORF1ab
产品规格:
1μg|100μg
发货周期:
1~3天
产品价格:
询价
pUC18 SARS-CoV-2 ORF1ab质粒所克隆的ORF1ab(168bp)含有中国疾控中心所公布的SARS-CoV-2冠状病毒基因组中开放读码框ORF1ab(open reading frame 1ab,ORF1ab)荧光检测RT-PCR特异性引物(1ab-F:5'-CCCTGTGGGTTTTACACTTAA-3';1ab-R:5'-ACGATTGTGCATCAGCTGA-3',该对引物扩增产生119bp片段)扩增所包含区域,该克隆适用于SARS-CoV-2的特异性检测。

SARS-CoV-2 ORF1大约占整个基因组长度的三分之二,位于病毒基因组5'端,编码病毒复制酶,包括ORF1a和ORF1b。ORF1a和ORF1b分别编码两个多聚蛋白(poly-protein)即pp1a和pp1ab,多聚蛋白产生后,被病毒编码的类胰凝乳蛋白酶(chymotrypsin-like protease,3CLpro)或1-2个类木瓜蛋白酶(papain-like protease,PLP)水解为具有独立生物学功能的十六个非结构蛋白(NSP1-NSP16),其中ORF1a编码NSP1-NSP11,而ORF1b编码NSP12-16。

pUC18 SARS-CoV-2 ORF1ab质粒的主要信息如下:
Feature NucleotidePosition
M13/pUC Forward Primer378-395
ORF1ab405-572
Multiple cloning site573-594
M13/pUC Reverse Primer608-625
Lac operator633-649
Lac Promoter657-687
ColE1 origin of replication(Ori)1011-1599
Synthetic Beta-lactamase (Ampr) coding region1770-2630


pUC18 SARS-CoV-2 ORF1ab质粒(2830bp)的图谱如下:
pUC18 SARS-CoV-2 ORF1ab质粒

pUC18 SARS-CoV-2 ORF1ab质粒的多克隆位点的详细图谱如下:
pUC18 SARS-CoV-2 ORF1ab质粒

pUC18 SARS-CoV-2 ORF1ab质粒中没有的酶切位点包括:
AccIAfeIAflIIAgeIAleIApaIAscI
AsiSIAvrIIBaeIBbsIBbvCIBfuAIBglII
BlpIBmgBIBmtIBpu10IBsaAIBsaBIBseRI
BsgIBsiWIBsmFIBsmIBspDIBspEIBspMI
BsrGIBssHIIBstBIBstEIIBstXIBstZ17IBsu36I
BtgIBtgZIClaICspCIDraIIIEagIEcoNI
EcoRVFseIHincIIHpaIMfeIMluIMscI
NaeINcoINgoMIVNheINotINruINsiI
PacIPaeR7IPflFIPflMIPmeIPmlIPpuMI
PshAIPsiIPspOMIPspXIPstIRsrIISacII
SalISbfISexAISfiISgrAISnaBISpeI
SphISrfIStuIStyISwaITth111IXbaI
XcmIXhoI


pUC18 SARS-CoV-2 ORF1ab质粒中的单酶切位点包括:
AatIIG,ACGT`C966EcoO109IRG`GNC,CY2571
Acc65IG`GTAC,C660EcoRIG`AATT,C1324
AflIIIA`CRYG,T664HindIIIA`AGCT,T1460
AhdIGACNN,NN`NGTC999KasIG`GCGC,C2654
AlwNICAG,NNN`CTG4176KpnIG,GTAC`C2572
ApoIR`AATT,Y977NarIGG`CG,CC240
AvaIC`YCGR,G935NdeICA`TA,TG597
BamHIG`GATC,C1231NmeAIIIGCCGAG(N)19,NN`977
BanIIG,RGCYC971PciIA`CATG,T4490
BcgI,NN`(N)10CGA(N)6TGC(N)10,NN`601PluTIG,GCGC`C2690
BclIT`GATC,A3561SacIG,AGCT`C2575
BpmICTGGAG(N)14,NN`1624SapIGCTCTTCN`NNN,995
BsaIGGTCTCN`NNNN,2390ScaIAGT|ACT951
BsaXI,NNN`(N)9AC(N)5CTCC(N)7,NNN`977SfoIGGC|GCC1077
BseYIC`CCAG,C2412SmaICCC|GGG3088
BsoBIC`YCGR,G2805SspIAAT|ATT655
BspQIGCTCTTCN`NNN,3254TspMIC`CCGG,G965
BsrFIR`CCGG,Y1413XmaIC`CCGG,G2347
BstAPIGCAN,NNN`NTGC2412XmnIGAANN|NNTTC2573
Eco53kIGAG|CTC382ZraIGAC|GTC346


pUC18 SARS-CoV-2 ORF1ab质粒中推荐使用的测序引物序列如下:
M13 fwd(378-395):5'- TGTAAAACGACGG CCAGT -3'
M13 rev (608-625):5'- CAGGAAACAGCTATGACC -3'

使用说明:
  • 首次使用1μg包装的本产品时,请先取少量本质粒转化大肠杆菌,进行质粒小量、中量或大量抽提后再用于后续用途。抽提获得的质粒可以通过酶切电泳进行鉴定,或通过测序进行鉴定。
  • 100μg包装的本产品质粒浓度为0.1μg/μl,共1ml。可以直接用于酶切。

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